Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms