Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uchl3Q9JKB1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl3Q9JKB1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms