Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnga3Q9JJZ8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnga3Q9JJZ8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms