Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.6 ms