Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Efcc1Q9JJF6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Efcc1Q9JJF6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efcc1Q9JJF6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms