Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Rpf2Q9JJ80 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms