Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cacna1fQ9JIS7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacna1fQ9JIS7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1fQ9JIS7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms