Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Copb1Q9JIF7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copb1Q9JIF7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copb1Q9JIF7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms