Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Klhl1Q9JI74 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl1Q9JI74 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms