Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Tm9sf3Q9ET30 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tm9sf3Q9ET30 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Tm9sf3Q9ET30 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Tm9sf3Q9ET30 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Tm9sf3Q9ET30 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Tm9sf3Q9ET30 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms