Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zcchc17Q9ESX4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zcchc17Q9ESX4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zcchc17Q9ESX4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms