Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Rb1cc1Q9ESK9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Rb1cc1Q9ESK9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Rb1cc1Q9ESK9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms