Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cmtm7Q9ESD6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Cmtm7Q9ESD6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmtm7Q9ESD6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmtm7Q9ESD6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmtm7Q9ESD6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmtm7Q9ESD6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmtm7Q9ESD6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmtm7Q9ESD6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmtm7Q9ESD6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmtm7Q9ESD6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmtm7Q9ESD6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmtm7Q9ESD6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cmtm7Q9ESD6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cmtm7Q9ESD6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cmtm7Q9ESD6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cmtm7Q9ESD6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms