Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ush1cQ9ES64 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ush1cQ9ES64 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ush1cQ9ES64 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms