Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SelenofQ9ERR7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelenofQ9ERR7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelenofQ9ERR7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelenofQ9ERR7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelenofQ9ERR7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SelenofQ9ERR7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelenofQ9ERR7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelenofQ9ERR7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelenofQ9ERR7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenofQ9ERR7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenofQ9ERR7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenofQ9ERR7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenofQ9ERR7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenofQ9ERR7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenofQ9ERR7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms