Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tubb3Q9ERD7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tubb3Q9ERD7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb3Q9ERD7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb3Q9ERD7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb3Q9ERD7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb3Q9ERD7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb3Q9ERD7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb3Q9ERD7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb3Q9ERD7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb3Q9ERD7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb3Q9ERD7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb3Q9ERD7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb3Q9ERD7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb3Q9ERD7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms