Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr9Q9EQU3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr9Q9EQU3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms