Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms