Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCQ7

Serpina1f, Alpha-1-antitrypsin 1-6, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1fQ9DCQ7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpina1fQ9DCQ7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Serpina1fQ9DCQ7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms