Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MNCb-2875Q9DCB3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.7 ms