Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rnf6Q9DBU5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf6Q9DBU5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms