Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ftsj3Q9DBE9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ftsj3Q9DBE9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms