Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnn3Q9DAW9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnn3Q9DAW9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnn3Q9DAW9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnn3Q9DAW9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn3Q9DAW9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn3Q9DAW9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn3Q9DAW9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn3Q9DAW9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn3Q9DAW9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn3Q9DAW9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn3Q9DAW9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn3Q9DAW9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn3Q9DAW9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn3Q9DAW9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn3Q9DAW9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn3Q9DAW9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn3Q9DAW9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn3Q9DAW9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn3Q9DAW9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn3Q9DAW9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn3Q9DAW9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn3Q9DAW9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms