Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asf1bQ9DAP7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms