Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9DA42 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9DA42 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9DA42 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9DA42 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9DA42 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9DA42 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9DA42 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9DA42 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9DA42 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9DA42 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9DA42 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9DA42 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9DA42 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9DA42 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9DA42 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9DA42 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9DA42 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9DA42 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9DA42 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9DA42 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9DA42 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9DA42 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9DA42 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9DA42 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q9DA42 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q9DA42 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q9DA42 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9DA42 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9DA42 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9DA42 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9DA42 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9DA42 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9DA42 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9DA42 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9DA42 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9DA42 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9DA42 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9DA42 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9DA42 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9DA42 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9DA42 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9DA42 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9DA42 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9DA42 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9DA42 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9DA42 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9DA42 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9DA42 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9DA42 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9DA42 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9DA42 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9DA42 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9DA42 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9DA42 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9DA42 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9DA42 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9DA42 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9DA42 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9DA42 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9DA42 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9DA42 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9DA42 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9DA42 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9DA42 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9DA42 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9DA42 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9DA42 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9DA42 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9DA42 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9DA42 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9DA42 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9DA42 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9DA42 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9DA42 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9DA42 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9DA42 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9DA42 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9DA42 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9DA42 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9DA42 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9DA42 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9DA42 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9DA42 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9DA42 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9DA42 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9DA42 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9DA42 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9DA42 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9DA42 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9DA42 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9DA42 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9DA42 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9DA42 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9DA42 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9DA42 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9DA42 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9DA42 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9DA42 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9DA42 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms