Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmbim4Q9DA39 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmbim4Q9DA39 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmbim4Q9DA39 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmbim4Q9DA39 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmbim4Q9DA39 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmbim4Q9DA39 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmbim4Q9DA39 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmbim4Q9DA39 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmbim4Q9DA39 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmbim4Q9DA39 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmbim4Q9DA39 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmbim4Q9DA39 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmbim4Q9DA39 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmbim4Q9DA39 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms