Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd8Q9DA37 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd8Q9DA37 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd8Q9DA37 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd8Q9DA37 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd8Q9DA37 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd8Q9DA37 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd8Q9DA37 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd8Q9DA37 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd8Q9DA37 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms