Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smco2Q9DA21 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smco2Q9DA21 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms