Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Actrt1Q9D9J3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actrt1Q9D9J3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms