Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Q9D9H8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Q9D9H8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Q9D9H8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Q9D9H8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Q9D9H8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Q9D9H8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Q9D9H8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Q9D9H8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Q9D9H8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Q9D9H8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Q9D9H8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Q9D9H8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Q9D9H8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Q9D9H8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Q9D9H8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Q9D9H8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Q9D9H8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Q9D9H8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Q9D9H8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Q9D9H8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Q9D9H8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms