Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco5aQ9D9D5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmco5aQ9D9D5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmco5aQ9D9D5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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