Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atg7Q9D906 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms