Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tvp23bQ9D8T4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tvp23bQ9D8T4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tvp23bQ9D8T4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tvp23bQ9D8T4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tvp23bQ9D8T4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tvp23bQ9D8T4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tvp23bQ9D8T4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tvp23bQ9D8T4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms