Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D8Q6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms