Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D8N1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D8N1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D8N1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D8N1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D8N1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D8N1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D8N1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D8N1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D8N1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D8N1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D8N1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D8N1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D8N1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D8N1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D8N1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D8N1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D8N1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D8N1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D8N1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D8N1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D8N1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D8N1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D8N1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D8N1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D8N1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D8N1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D8N1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D8N1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D8N1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms