Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K8

Slc25a39, Solute carrier family 25 member 39, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a39Q9D8K8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Slc25a39Q9D8K8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc25a39Q9D8K8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Slc25a39Q9D8K8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Slc25a39Q9D8K8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Slc25a39Q9D8K8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Slc25a39Q9D8K8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc25a39Q9D8K8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Slc25a39Q9D8K8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms