Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slc52a2Q9D8F3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slc52a2Q9D8F3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slc52a2Q9D8F3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slc52a2Q9D8F3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slc52a2Q9D8F3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slc52a2Q9D8F3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slc52a2Q9D8F3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slc52a2Q9D8F3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slc52a2Q9D8F3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Slc52a2Q9D8F3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slc52a2Q9D8F3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Slc52a2Q9D8F3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slc52a2Q9D8F3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slc52a2Q9D8F3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slc52a2Q9D8F3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slc52a2Q9D8F3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slc52a2Q9D8F3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slc52a2Q9D8F3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Slc52a2Q9D8F3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms