Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 730.7 ms