Protein–RNA interactions for Protein: Q9D869

Chp2, Calcineurin B homologous protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp2Q9D869 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chp2Q9D869 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chp2Q9D869 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chp2Q9D869 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms