Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vstm5Q9D806 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm5Q9D806 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms