Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S7

Rpl22l1, 60S ribosomal protein L22-like 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl22l1Q9D7S7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpl22l1Q9D7S7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl22l1Q9D7S7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1351.2 ms