Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2dQ9D7M8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2dQ9D7M8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2dQ9D7M8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms