Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn23Q9D7D7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn23Q9D7D7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn23Q9D7D7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn23Q9D7D7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn23Q9D7D7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn23Q9D7D7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn23Q9D7D7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn23Q9D7D7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cldn23Q9D7D7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn23Q9D7D7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn23Q9D7D7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn23Q9D7D7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn23Q9D7D7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn23Q9D7D7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn23Q9D7D7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn23Q9D7D7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn23Q9D7D7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn23Q9D7D7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn23Q9D7D7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn23Q9D7D7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn23Q9D7D7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn23Q9D7D7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms