Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Srp19Q9D7A6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Srp19Q9D7A6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Srp19Q9D7A6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms