Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufb8Q9D6J5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb8Q9D6J5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb8Q9D6J5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb8Q9D6J5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb8Q9D6J5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb8Q9D6J5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb8Q9D6J5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb8Q9D6J5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb8Q9D6J5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb8Q9D6J5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb8Q9D6J5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufb8Q9D6J5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufb8Q9D6J5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufb8Q9D6J5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufb8Q9D6J5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufb8Q9D6J5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms