Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Rab11fip1Q9D620 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Rab11fip1Q9D620 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Rab11fip1Q9D620 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Rab11fip1Q9D620 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab11fip1Q9D620 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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