Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PudpQ9D5U5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PudpQ9D5U5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms