Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn11Q9D572 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn11Q9D572 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.7 ms