Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Zcchc13Q9D548 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Zcchc13Q9D548 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Zcchc13Q9D548 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Zcchc13Q9D548 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zcchc13Q9D548 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Zcchc13Q9D548 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Zcchc13Q9D548 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Zcchc13Q9D548 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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