Protein–RNA interactions for Protein: Q9D542

4930470P17Rik, RIKEN cDNA 4930470P17, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930470P17RikQ9D542 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930470P17RikQ9D542 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4930470P17RikQ9D542 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms